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中國醫學科學院(下稱院)成立于1956年，是我國唯一的國家級醫學科學學術中心和綜合性醫學科學研究機構。北京協和醫學院(下稱校)由美國洛克菲勒基金會于1917年創辦，是我國最早設有八年制臨床醫學專業和護理本科教育的重點醫學院校。黨中央、國務院和國家歷屆領導人對院校的發展十分關心支持。江澤民主席1997年親筆為院校題寫了“嚴謹、博精、創新、奉獻”的院校訓;胡錦濤主席和溫家寶總理對院校發展寄予了深切關注和殷切期望，溫家寶總理指出：“協和具有辦學的有利條件和優良的教學傳統，應該辦好，也一定能夠辦好，辦出協和的特色，為國家培養高質量的醫學人才。”

醫科院與協和醫學院實行院校合一的管理體制，醫科院為協和醫學院提供雄厚的師資和技術力量，協和醫學院為醫科院培養高層次的人才，相互依托，優勢互補，教研相長。院校設有18個研究所(以及5個分所)、7所臨床醫院(含與北京市共建的天壇醫院)、6所學院、1個研究生院。院校擁有一大批在醫藥衛生領域內經驗豐富、學術水平較高并做出杰出貢獻的著名專家、教授。現有中國科學院和中國工程院兩院院士28人，“千人計劃”人選14人，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授15人，長江學者講座教授3人，杰出青年基金獲得者35人，國家級和部委級有突出貢獻的中青年專家107人，國務院學位委員會委員1人、學科評議組成員9人(其中3人為學科評議組組長)，在崗博士生導師654人，碩士生導師845人。

協和醫學院堅持小規模招生、高層次培養、高質量輸出的辦學宗旨，在長期的辦學實踐中，凝練出“堅持醫學精英教育、實行高進優教嚴出、注重能力素質培養、強調三高三基三嚴、開放辦學博采眾長、傳揚優良文化傳統”的辦學特色。我校是首批具有博士學位和碩士學位授予權的單位，現有一級學科博士授權專業點8個、一級學科碩士授權專業點3個，是國務院學位委員會自行審核博士學位授權一級學科點和碩士學位授權一級學科點的委托學位授予單位。現有一級學科國家重點學科2個，二級學科國家重點學科8個，三級學科國家重點學科2個，國家重點培育學科1個。可分別授予醫學博士、理學博士(哲學博士)、醫理雙博士、工學博士、醫學碩士、理學碩士、工學碩士和管理學碩士等學位，每年授予博士學位人數位居全國醫學院校首位。現有各類在校生4726人，其中研究生3862人占82%，普通本科生與成人本科生628人占13%，普通專科生236人占5%，呈典型的“倒金字塔”結構。多年來為國家培養了大批優秀的臨床醫學家、醫學科學家、醫學教育家、護理學家和醫政管理學家，為我國醫學教育、醫學科學研究和醫療衛生事業的進步和發展做出了積極的貢獻，在國內外享有很高的聲譽。